Small RNA(主要包括miRNA、piRNA、siRNA)調控靶基因表達,
參與生長發育過程和疾病發生發展,小RNA 測序可快速鑒定出已知和未知的小RNA,
為研究小RNA 的功能及調控機制提供有力工具。
從選材到后續研究內容相關信息的挖掘,整個流程嚴謹進行,全程跟蹤。
實時追蹤項目進展,一切動向盡在掌握。
意見直接反饋項目經理,高效解決。
可對在線項目各維度的服務進行評價。
公司成立八年以來,擁有豐富的醫學項目分析經驗,累計完成5千多個樣品的醫學轉錄調控研究
醫學物種涉及人、鼠,樣本類型包括常見組織或細胞,以及體液、毛囊等特殊樣本
公司擁有 40 余項專利技術和 150 余項軟件著作權,根據項目需要選擇方案,保障結果精準
結果展示
由于Dicer酶和DCL酶的特異性,最終生成的成熟miRNA長度主要集中在20nt到24nt的范圍內,動物的miRNA以22nt為主,通過軟件分析鑒定出的已知miRNA和新miRNA。
miRNA存在轉錄后堿基的編輯,導致種子序列(seed sequence)改變,進而使得作用的靶基因發生改變。
對各樣本中已知和新miRNA進行表達量的統計,miRNA表達量總體分布圖可以反映樣品中miRNA的整體表達模式。
分析差異表達miRNA靶基因在某一通路上是否過出現(over-presentation)即為差異表達miRNA靶基因的Pathway富集分析。利用富集因子(Enrichment Factor)分析通路的富集程度,并利用Fisher精確檢驗方法計算富集顯著性。
提供總RNA即可,針對小RNA測序,會有相應的片段篩選,進行片段選擇之后,進行小RNA建庫,建庫采用針對小RNA進口試劑盒。
miRNA轉錄起始位點多位于基因間隔區、內含子以及編碼序列的反向互補序列上,其前體具有標志性的發夾結構,成熟體的形成是由Dicer/DCL酶的剪切實現的。針對miRNA的生物特征,對于比對到參考基因組的序列,百邁客利用miRDeep2軟件和小RNA數據庫進行已知miRNA及新的miRNA預測。
考慮到實驗設計原則,建議做生物學重復。